More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3714 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
132 aa  253  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  44.92 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
140 aa  87  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 
124 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0931  camphor resistance CrcB protein  43.1 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.683731  hitchhiker  0.00174486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  40.38 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  39.82 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  44.55 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  36.75 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  41.88 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  38.84 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  36.21 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  37.19 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  37.5 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  39.66 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  39.84 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  33.91 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  33.61 
 
 
116 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  39.81 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  35.34 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  38.79 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  34.75 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0519  Camphor resistance CrcB protein  39.66 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  41.59 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  35.83 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  38.26 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  37.39 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  40.7 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  31.36 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  37.5 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  37.93 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  43.62 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0494  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  34.78 
 
 
118 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  35.19 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  33.06 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1098  camphor resistance CrcB protein  35.34 
 
 
140 aa  66.6  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.25603  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  37.29 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  34.91 
 
 
123 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  35.29 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  36.67 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  31.36 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  34.43 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  31.01 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  35.34 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  40.86 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  33.96 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 
127 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  27.42 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  36.04 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  33.33 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  32.2 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  33.04 
 
 
228 aa  61.6  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  31.93 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>