More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1916 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
122 aa  235  2e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  43.7 
 
 
129 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  38.89 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  38.89 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  41.46 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  41.07 
 
 
133 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  39.17 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  41.46 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  37.61 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  45.45 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  47.37 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  38.21 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  41 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  39.47 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  39 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  43.01 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0930  camphor resistance CrcB protein  36.97 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.942183  hitchhiker  0.00352151 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  33.93 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  38.39 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  47.62 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  35 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  38.52 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  37.62 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1283  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139326  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  41.49 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  40.2 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  42.35 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  35.85 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  35.4 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  35.79 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  36.13 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  37.61 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  40.86 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1099  crcB protein  34.75 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.236283  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  35.83 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  34.91 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 
122 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  39.47 
 
 
127 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  42.71 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  37.11 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  39.13 
 
 
127 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  36.26 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  35.83 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  33.33 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>