More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0513 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  100 
 
 		 125 aa  235  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  45.08 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  45.3 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 122 aa  88.6  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  46.85 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  46.85 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  39.34 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  41.32 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  40.8 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  44.21 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  38.4 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  44.76 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  41.88 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  41.88 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  39.62 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  44.33 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 122 aa  76.6  0.00000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  50 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  45.65 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  38.14 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  33.33 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  38.53 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  40.57 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  39.83 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  47.25 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  35.9 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  47.62 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  47.62 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  40.57 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  35.77 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  35.77 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  39.22 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  35.9 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  39.62 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  37.4 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  36.45 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  39.62 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  39.62 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  39.62 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  45.26 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  44.21 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  41.18 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  39.62 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  39.62 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  39.45 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  39.05 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  36.92 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  39.09 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  34.75 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  39.05 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  41.76 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  38.68 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  39.62 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  37.61 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  40.43 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>