More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2285 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  100 
 
 
125 aa  244  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  56.1 
 
 
124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  60 
 
 
124 aa  123  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  46.4 
 
 
126 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  40.65 
 
 
124 aa  103  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
123 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
124 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0461  Camphor resistance CrcB protein  51.04 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.32096 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0908  CrcB protein  49.53 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.862739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 
125 aa  83.6  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  43.4 
 
 
140 aa  83.6  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
129 aa  83.6  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  34.51 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  37.3 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  38.21 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
129 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  41.58 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  37.11 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  38.54 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  42.11 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  34.15 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  38.39 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  33.62 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  34.48 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  35.14 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  38.46 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  39.13 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  37.5 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  35.83 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  40.83 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  36.89 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
134 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  35.77 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  35.35 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1480  CrcB protein  37.93 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  34.65 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  40.62 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  40.62 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  40 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 
133 aa  67  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  35.04 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  33.87 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  31.93 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  42.06 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  32.52 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  34.15 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  29.84 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1338  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0111697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  35.14 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  28.1 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  32.28 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  37.11 
 
 
122 aa  62  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  38.38 
 
 
127 aa  62  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  33.9 
 
 
123 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>