More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2398 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
130 aa  251  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  73.08 
 
 
129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  72.73 
 
 
127 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  69.42 
 
 
129 aa  165  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  65 
 
 
129 aa  155  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  66.67 
 
 
128 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  60.33 
 
 
128 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  41.67 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  45.38 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  40.94 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  43.24 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  36.67 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  37.27 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  43.12 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  38.79 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 
128 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 
122 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  38.74 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  44.66 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  37.4 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  42.34 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  45.83 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  40.98 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  42.02 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  42.86 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.41 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  36.75 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  38.84 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  36.07 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  38.14 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  40.87 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  38.66 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  39.29 
 
 
193 aa  73.9  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  38.52 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  47.87 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  40 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  41.44 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  37.39 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  35.59 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  39.83 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  39.45 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  37.82 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  35.29 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  39.56 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  40.71 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  41.13 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  50.6 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  36.29 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  44.33 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  33.93 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  35.54 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  35 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  34.15 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  36.79 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  33.05 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  38.33 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  36.44 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0072  CrcB protein  42.16 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  39.82 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  39.81 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  42.45 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  39.84 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  30.43 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0037  CrcB protein  35.71 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000769905  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  39.36 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  37.14 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  42.39 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  37.61 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  41.28 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  38.21 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  41.07 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>