More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2385 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 127 aa  239  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  61.79 
 
 		 124 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  60.98 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  62.1 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  60.98 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  57.26 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  56.45 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  56.45 
 
 		 124 aa  146  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  46.61 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  39.47 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  39.02 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  41.46 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  43.7 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  33.33 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  33.61 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  42.28 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  42.64 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  47.25 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  35.04 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  43 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  35.04 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.46 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  37.6 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  41.46 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  41.27 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  40.83 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  36.59 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  43.24 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  48.19 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  48.19 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  35.25 
 
 		 123 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  46.81 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  44.09 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  45.3 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  44.09 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  34.13 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  34.96 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  41.18 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  44.66 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  43.43 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.44 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  45.83 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.44 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  37.9 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1284  integral membrane protein for chromosome condensation  43.18 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  37.1 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  28.46 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 162 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  32.48 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  42.71 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  35.19 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  41.05 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  47.31 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  38.52 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>