More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0072 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0072  CrcB protein  100 
 
 		 146 aa  272  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  43.81 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  41.88 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  42.72 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  45.87 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  43.43 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  45.79 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  46.53 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  31.58 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  40.37 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  41.04 
 
 		 169 aa  67  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  39.2 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  35.4 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  35.71 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  41.88 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  51.28 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  44.44 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  37.17 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  27.78 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  35.78 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  41.49 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  35 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  38.64 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  33.33 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  36.79 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  40.2 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  45.36 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  39.69 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  43.56 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  43.48 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  40.7 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  33.33 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  35.04 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  45.22 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  45.22 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  37.86 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  40.38 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  35.9 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  38.79 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  35.78 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  37.37 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  41.51 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  34.91 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  34.91 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  34.91 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  35.35 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  43.96 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  43.96 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  43.96 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  43.96 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  43.96 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  43.96 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 140 aa  57  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  34.78 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  33.71 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  37.84 
 
 		 122 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  31.54 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  35.78 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  34.86 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  35.65 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  29.46 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  35.78 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  35.78 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  31.58 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  35.78 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  35.78 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  35.78 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  38.6 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  39.58 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  32.74 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  36.11 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  38.16 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  30.19 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  37.25 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  36.54 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>