More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1422 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  100 
 
 		 130 aa  250  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  55.37 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  52.38 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  54.1 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  51.35 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  50.79 
 
 		 132 aa  103  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  52.21 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  45.83 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  49.56 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  47.17 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  53.1 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  48.25 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  50.4 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  39.68 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  42.74 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  43.55 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  43.55 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  51.61 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  34.96 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  37.19 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  37.19 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  49.55 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  38.58 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  42.4 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  37.8 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  37.01 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  58.33 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  38.33 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  40.59 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  33.33 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  38.4 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  38.76 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  44.32 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  39.64 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  39.47 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  36.89 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 128 aa  67  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  44.21 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  38.3 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  41.28 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.54 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  38.95 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  33.33 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  37.01 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  40.87 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  37.84 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  33.6 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  34.17 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  35.59 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  40.62 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.89 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  33.9 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  36 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  37.89 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  36.36 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  33.63 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  33.33 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  39.02 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  33.63 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  41 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>