More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2766 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  100 
 
 		 127 aa  243  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  51.24 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  52 
 
 		 125 aa  116  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  50.41 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  57.94 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  52.42 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  48 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  50.43 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  50.86 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  47.58 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  47.58 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  45.53 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  45.97 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  49.18 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  45.97 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  47.54 
 
 		 124 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  47.54 
 
 		 124 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  51.69 
 
 		 132 aa  97.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  47.54 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  51.22 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  53.85 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  51.35 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  48.03 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  46.73 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  50.91 
 
 		 113 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  52.83 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  46.49 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  50.53 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  45.97 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  44.8 
 
 		 140 aa  87.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 123 aa  86.7  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.13 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  43.44 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  43.8 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  45.26 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  46.32 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  45.26 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  45.26 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  45.26 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  48.15 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  47.22 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  35.77 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  40.54 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  44.79 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  45.24 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  38.46 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  36.73 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  40.43 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  38.46 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  40.43 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  38.6 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  40.16 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  39.78 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  35 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  38.21 
 
 		 193 aa  73.6  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  36.21 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.05 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.05 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  47.25 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  44.44 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  44.21 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  34.13 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  35.09 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  40.59 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>