More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2926 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 		 125 aa  243  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  100 
 
 		 125 aa  243  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  58.06 
 
 		 193 aa  138  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  50.89 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  51.06 
 
 		 228 aa  87.8  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  41.96 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  44.76 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  47.73 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  49.44 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  46.08 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  43.33 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  40 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  42.34 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  40 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  39.25 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  45.65 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  46.15 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  47.19 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  39.64 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  39.64 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  45.33 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  41.38 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  41.67 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  41.49 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  37.3 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  42.86 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  40.17 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  44.32 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  44.32 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  37.61 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  45.56 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  43.1 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  39.22 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  41.59 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  40.21 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  39.66 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3455  hypothetical protein  41.88 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0794685 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  40.62 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  39.42 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  38.98 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  36.19 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  45.24 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  44.04 
 
 		 126 aa  66.6  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  38.24 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  36.44 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  38.94 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  39.18 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  43.37 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  39.32 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  44.09 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  42.28 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  36.19 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  37.84 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  39.36 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  35.42 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  38.79 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  39.22 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  38.38 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  37.25 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  35.24 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>