More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3455 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3455  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  253  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0794685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  53.97 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  56.56 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  56.48 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  50.43 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  47.27 
 
 		 133 aa  88.6  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  47.27 
 
 		 133 aa  88.6  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  51.35 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  49 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  42.86 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  45.37 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  47.93 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  47.06 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  44.72 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  49.51 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  43.86 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  42.2 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  44.04 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  44.72 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  37.74 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  42.2 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  41.88 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  41.88 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  43.64 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  45.71 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.51 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  38.05 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.51 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  41.67 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  44.26 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  45.92 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  42.2 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  45.65 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  44.9 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  44.9 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  35.71 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  39.47 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  45.38 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  37.1 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  39.52 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  34.88 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1915  camphor resistance CrcB protein  47.01 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  40.17 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  41.82 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  38.71 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  35.88 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  33.08 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  40.87 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  32.17 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  33.61 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  32.17 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  36.13 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  44.68 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  35.4 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  38 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  38 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  34.15 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  39.52 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  34.95 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  29.66 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  38.32 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  42.2 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  40.94 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  37.19 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  36.43 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0908  CrcB protein  48.81 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.862739  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>