More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2473 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  100 
 
 
124 aa  233  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  83.47 
 
 
121 aa  192  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  60.16 
 
 
133 aa  133  8e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 
124 aa  101  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 
124 aa  98.6  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 
124 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  47.41 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  49.11 
 
 
128 aa  95.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  50.53 
 
 
126 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  45 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  44.17 
 
 
131 aa  94  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  50.53 
 
 
126 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 
124 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  48.25 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  49.06 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  47.27 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 
124 aa  92  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  47.01 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  49.47 
 
 
126 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  48.08 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  44.74 
 
 
131 aa  90.1  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  45.22 
 
 
140 aa  89.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  50.46 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  50.54 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  44.86 
 
 
125 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  45.83 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  43.22 
 
 
118 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  47.22 
 
 
123 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  48.15 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  41.6 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
129 aa  87  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  50 
 
 
193 aa  87  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  44.66 
 
 
125 aa  86.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  41.8 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  48.62 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  50.48 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  44.83 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  43.93 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  40.37 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  51.89 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
124 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  44.26 
 
 
136 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  39.52 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  48.25 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  44.34 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  41.38 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  50 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  40.19 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  46.3 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 
162 aa  80.1  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  42.98 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  43.9 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  42.64 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  42.86 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  43 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  48.94 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  40.91 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  42.02 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  43.33 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  41.6 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  42.24 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.84 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  43.33 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.84 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  44.63 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  44.72 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  39.05 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  33.06 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  44.34 
 
 
128 aa  77  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  44.44 
 
 
129 aa  77  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  40.19 
 
 
123 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 
125 aa  76.6  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
125 aa  76.6  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  45.26 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>