More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4768 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  100 
 
 
131 aa  253  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  58.54 
 
 
124 aa  129  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  58.54 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  53.66 
 
 
128 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  59.09 
 
 
124 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  55.83 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  55.83 
 
 
124 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  50.83 
 
 
122 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  48.39 
 
 
134 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  45.83 
 
 
130 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  48.39 
 
 
126 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  52.5 
 
 
122 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  44.17 
 
 
128 aa  100  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  46.72 
 
 
125 aa  100  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  51.4 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  45.08 
 
 
128 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  49.54 
 
 
127 aa  94  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  47.32 
 
 
113 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.74 
 
 
124 aa  90.1  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  43.33 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  41.6 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  41.6 
 
 
125 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  48.15 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  41.46 
 
 
128 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  60.27 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  43.86 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  41.23 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  42.48 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  40.16 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  39.84 
 
 
124 aa  76.6  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  40 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  35.83 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  35.83 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  41.88 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  42.37 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  43.44 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  39.47 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  46.88 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  38.1 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  42.37 
 
 
270 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  36.51 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  42.24 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  36.75 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  41.13 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  34.35 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  43.33 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  39.17 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  37.14 
 
 
134 aa  67  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  34.4 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  41.49 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  42.39 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  35.14 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  35.58 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  35.16 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  38.05 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  36.21 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  33.91 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  35.58 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  40.86 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  36.59 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  37.19 
 
 
193 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  36.54 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  34.38 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  43.56 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  39.78 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>