More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0290 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  61.6 
 
 		 124 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  61.6 
 
 		 124 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  68.22 
 
 		 109 aa  134  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  72.53 
 
 		 105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  47.97 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  49.6 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  46.34 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  49.57 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  49.21 
 
 		 127 aa  85.5  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  43.8 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  43.7 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  40.32 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  47.37 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  36.31 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  45.53 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  47.5 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  39.2 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  42.37 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  45.45 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  46.22 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  42.19 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  43.09 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  42.5 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  43.65 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  37.9 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  43.8 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  39.69 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  46.85 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  46.46 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  40.65 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  50.53 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  39.02 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  44.04 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  39.02 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  40.56 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0149  crcB protein  49.12 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  44.63 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  43.96 
 
 		 270 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  50 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  39.83 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  39.84 
 
 		 131 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  41.59 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  41.11 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  39.42 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  48.25 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  43.69 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  41.59 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  41.6 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  37.8 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  39.52 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  36.72 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  41 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  35 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  49 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  35.29 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  38.71 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.41 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  35.88 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  45.95 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  39.67 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  40.59 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  43.9 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  38 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  37.17 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  45.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>