More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0149 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0149  crcB protein  100 
 
 		 126 aa  228  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  44.8 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  51.75 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  46.28 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  47.22 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  45.37 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  36.22 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.34 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  37.01 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  40.37 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  36.52 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  41.28 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  41.38 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  36.22 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  37.93 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  40.66 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  36.59 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  51.76 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  42.22 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  49.46 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  47.37 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  50 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  42.74 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 		 270 aa  61.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  39.66 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  34.55 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  41.18 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  49.35 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  41.74 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0954  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  39.66 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  56.76 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  46.53 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  54.67 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  31.2 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  34.51 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  31.2 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  31.2 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  42.02 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  38.53 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  38.02 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  41.74 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  42.74 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  42.86 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  38.21 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  48.86 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  39.6 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  46.32 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  46.99 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  44.57 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  43.36 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  37.39 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  39.68 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  42.98 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  38.94 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  39.66 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  39.81 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  46.49 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>