More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0954 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0954  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  43.64 
 
 
120 aa  87  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  45.37 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1283  camphor resistance protein CrcB  46.85 
 
 
120 aa  84  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139326  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  36.7 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  37.96 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  40.54 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 
137 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0930  camphor resistance CrcB protein  40.54 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.942183  hitchhiker  0.00352151 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  44.57 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  35.4 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  39.08 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  37.08 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  41.46 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  37.08 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  40.23 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  40 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  35.4 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  39.78 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  35.4 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  39.66 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  38.53 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  34.02 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1339  CrcB family protein  36.94 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0192605  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0149  crcB protein  39.29 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  40.22 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1099  crcB protein  35.51 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.236283  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  37.78 
 
 
127 aa  60.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  38.46 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  36.78 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  33.33 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  37.96 
 
 
118 aa  60.5  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.67 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  41.38 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  33.93 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  34.23 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  37.78 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  29.82 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  35.78 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  34.55 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  38.3 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  36.61 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  41.57 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  35.71 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  37.36 
 
 
127 aa  57.8  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  37.36 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  32 
 
 
120 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  37.86 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  36.63 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  31.62 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  33.33 
 
 
166 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  35.78 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  30.25 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  37.65 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  33.91 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  39.33 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  37.84 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  40.45 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.2 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  32.14 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  36.73 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  30.43 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  35.19 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 
125 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  31.03 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>