More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1636 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  100 
 
 		 124 aa  236  8e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  39.42 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.86 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  43.8 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  40.16 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  39.52 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  41.46 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  41.74 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  45 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  41.32 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  36.67 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1480  CrcB protein  43.22 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  40.68 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  39.02 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  37.5 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  42.57 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  39.02 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  38.14 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  40.68 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  42.02 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  37.82 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  33.05 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  42.02 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  43.53 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  42.86 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  43.68 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  42.39 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  41 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  33.33 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1283  camphor resistance protein CrcB  31.71 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  41.11 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  38.14 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  30.4 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  30.4 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  30.4 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  38.4 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  33.87 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  36.89 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  38.37 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0089  camphor resistance protein CrcB  31.25 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  33.33 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  33.6 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  36.44 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  30.89 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  35.29 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>