More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2870 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
150 aa  290  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  97.62 
 
 
126 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  78.57 
 
 
126 aa  197  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  64.42 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  63.46 
 
 
127 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  53.6 
 
 
127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  52.38 
 
 
129 aa  134  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 
128 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 
128 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 
137 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  49.23 
 
 
147 aa  120  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  50.83 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  50.83 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  50.83 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  50.83 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  48.31 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  50.83 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  53.39 
 
 
135 aa  118  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  48.39 
 
 
129 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  49.17 
 
 
128 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  45.9 
 
 
127 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  45.9 
 
 
127 aa  117  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  45.9 
 
 
127 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  55.56 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  48.36 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  51.79 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  49.18 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  47.58 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  48.33 
 
 
125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 
126 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  52.5 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  53.39 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  49.11 
 
 
127 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  50.81 
 
 
124 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  49.11 
 
 
127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  49.11 
 
 
127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  53.7 
 
 
128 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  48.21 
 
 
127 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  48.21 
 
 
127 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  48.21 
 
 
127 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  48.21 
 
 
127 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  48.21 
 
 
127 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  48 
 
 
126 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  50.41 
 
 
146 aa  103  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  50.53 
 
 
127 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  48.78 
 
 
154 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 
126 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  48.76 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  48.74 
 
 
128 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  44 
 
 
127 aa  98.6  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  46.4 
 
 
125 aa  97.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  50.94 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  50.94 
 
 
131 aa  97.1  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 
126 aa  94  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  45 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  44.92 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01045  putative Protein CrcB-like protein  51.25 
 
 
87 aa  84  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0985412  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06121  putative Protein CrcB-like protein  51.25 
 
 
87 aa  84  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0202562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0215  camphor resistance protein CrcB  47.2 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.181294  hitchhiker  0.00640614 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3474  camphor resistance protein CrcB  46.46 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  42.39 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0235  crcB protein  44.8 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.616495  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  37.96 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  36.44 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  34.04 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  37.14 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  32.17 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>