263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3565 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
134 aa  267  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
134 aa  267  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
134 aa  267  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  48.8 
 
 
270 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5116  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 
127 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1467  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
127 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1305  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 
127 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  44.04 
 
 
254 aa  100  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  30.4 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  32.76 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  32 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  34.78 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  28.23 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  29.75 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  33.06 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  33.61 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  36.14 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  32.26 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  32.26 
 
 
126 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
120 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  37.08 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  29.57 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1338  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0111697  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  36.78 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  31.03 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  34.94 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  28.18 
 
 
126 aa  58.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  34.94 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  27.34 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  36 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  34.91 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  29.27 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  32.14 
 
 
124 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  31.03 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  34.21 
 
 
118 aa  57  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  30.17 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  33.07 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  33.71 
 
 
126 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  31.34 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  30.51 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  29.69 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  33.73 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
118 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  29.31 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  27.62 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  28.7 
 
 
122 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  31.9 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  32.03 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  30.17 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  33.7 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0242  Camphor resistance CrcB protein  34.88 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  29.32 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
118 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  31.86 
 
 
129 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  30 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  32.14 
 
 
123 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  32.14 
 
 
121 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  28.97 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  30 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  32.53 
 
 
127 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  32.53 
 
 
127 aa  52  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  31.73 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  32.53 
 
 
127 aa  52  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  32.53 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  32.53 
 
 
127 aa  52  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  32.53 
 
 
127 aa  52  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  32.53 
 
 
127 aa  52  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  31.93 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A24  camphor resistance protein CrcB  31.15 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  31.73 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  31.73 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  31.73 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  32.53 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  28.57 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  32.53 
 
 
127 aa  52  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  31.62 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  29.9 
 
 
127 aa  52  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  27.35 
 
 
128 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  33.03 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  34.91 
 
 
129 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  27.62 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  27.62 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  31.03 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  28.33 
 
 
132 aa  50.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  35.16 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  32.53 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  31.45 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  29.03 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  31.33 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  31.33 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>