More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0304 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  100 
 
 
193 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  58.06 
 
 
125 aa  138  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  58.06 
 
 
125 aa  138  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  44.26 
 
 
124 aa  96.7  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 
140 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
124 aa  93.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
124 aa  91.7  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  53.06 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  47.71 
 
 
124 aa  89  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
124 aa  88.6  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  50 
 
 
124 aa  87  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  44.86 
 
 
122 aa  84  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  44.35 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 
123 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  43.48 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  38.14 
 
 
124 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 
124 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  39.66 
 
 
123 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  43.44 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  39.64 
 
 
151 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  39.42 
 
 
123 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  34.65 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  37.1 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
124 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  38.21 
 
 
125 aa  77  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
129 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 
125 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
129 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  51.06 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  39.37 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  39.47 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  40.66 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  46.23 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  36.36 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  36.05 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  41.07 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  35.33 
 
 
162 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 
130 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 
124 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  40.54 
 
 
124 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  40.54 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  37.8 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  39.47 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  33.86 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  42.34 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  34.68 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  39.5 
 
 
128 aa  72  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
124 aa  72  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  34.65 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.93 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  33.33 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  37.01 
 
 
122 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  41.76 
 
 
129 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  38.33 
 
 
122 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
126 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  35.25 
 
 
128 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  39.13 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  42.86 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.04 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 
125 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  40.37 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  40.86 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  39.32 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  34.15 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  39.13 
 
 
143 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  37.5 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>