More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3560 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  100 
 
 		 128 aa  242  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  54.62 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  54.1 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  51.26 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  59.09 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  48.76 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  51.26 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  50.85 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  54.55 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  55.77 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  48.6 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  44.17 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  52.38 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  45.53 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  47.93 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  54.08 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  46.28 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  45.53 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  43.55 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  46.28 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  41.53 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  49.02 
 
 		 113 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.07 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  46.55 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  41.46 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  40.19 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  45.45 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  45.54 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  41.51 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  42.28 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  43.55 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  50.57 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  50.57 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  50.57 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  37 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  37 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  36.44 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  46.32 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  50.57 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  39.47 
 
 		 193 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  39.81 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  34.43 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  38.52 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  37.82 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  38.79 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  44.9 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  38.66 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  36 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  34.43 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  46.32 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  41.59 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  41.59 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  41.67 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  37.61 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  41.38 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  48.28 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  41.38 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  41.12 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  45.56 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  44.44 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  47.62 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  42.68 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>