More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2101 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  100 
 
 		 126 aa  241  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  49.19 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  47.46 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  46.61 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  46.77 
 
 		 124 aa  95.9  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  49.19 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  44.63 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  48.78 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  46.09 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  41.59 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  42.97 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  43.52 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  43.33 
 
 		 131 aa  87.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  43.7 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  45.9 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  45.9 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  41.13 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  45.97 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  43.9 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  40.95 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  46.3 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  43.09 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  41.38 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  45.28 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  43.1 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  42.16 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  49.04 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  44.8 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  42.16 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  47.87 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  42.99 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  42.99 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  42.99 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  42.99 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  36.44 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  47.42 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  42.16 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  35.59 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  38.4 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  43.69 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  40.16 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  37.93 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  44.26 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  35.59 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  56.16 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  36.44 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  45.19 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  36.44 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.26 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  44.79 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  38.52 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  40.52 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  47.97 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  37.82 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  43 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  40.5 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  42.45 
 
 		 166 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  38.52 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  44.19 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  43.8 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  40 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  37.93 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  41.24 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  40.16 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  42.24 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>