More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0975 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 131 aa  255  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  59.69 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  62.18 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  54.33 
 
 		 129 aa  140  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  47.69 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  50.41 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  46.09 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  47.29 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  45.67 
 
 		 270 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  48.74 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  45.87 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  47.17 
 
 		 228 aa  90.5  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  42.28 
 
 		 121 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  43.22 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  42.02 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.37 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  43.65 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  43.65 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  39.17 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  35.2 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 124 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  40.8 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  38.21 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  39.39 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  38.53 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  42.73 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  41.03 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  35.83 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  35.19 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  41.59 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  37.76 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  37.3 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  37.76 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1915  camphor resistance CrcB protein  42.61 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  40 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  35 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3455  hypothetical protein  45.37 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0794685 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  37.29 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  37.4 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  42.2 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  36.97 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  37.61 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  40.32 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  42.99 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  39.81 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  37.29 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  36.89 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  31.19 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  35.29 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  36.89 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  39.66 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  33.91 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  32.8 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  39.81 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>