More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1284 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 128 aa  241  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  43.7 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  44 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  44.92 
 
 		 124 aa  94.7  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  58.43 
 
 		 125 aa  93.6  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 124 aa  91.3  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  45.3 
 
 		 124 aa  90.5  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  44.9 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  44.17 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  44.9 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  44 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  43.93 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  43.93 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  43.93 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  43.93 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 124 aa  84.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  45.83 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  48.36 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  48.11 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.86 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  42.48 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  43.56 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  36.7 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  45.9 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  42.15 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.27 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  39.39 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  37.01 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  37.86 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  41.41 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  39.83 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  39.67 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  38.89 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  41.38 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  44.34 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  44.25 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  47.25 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  40.8 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  39 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  35.48 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  42.72 
 
 		 122 aa  72  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  39.17 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  37 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  37.01 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.84 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  35.29 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  37.86 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  41 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  43.93 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  43.62 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  40 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  40.66 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  45.05 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  33.05 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  36.17 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  35.38 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  40 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>