More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3430 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  239  7.999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  75.41 
 
 		 128 aa  187  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  68.55 
 
 		 124 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  68.47 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  58.54 
 
 		 131 aa  129  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  55.37 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  53.28 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  51.26 
 
 		 128 aa  120  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  49.18 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  55.08 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  54.47 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  50 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  50.85 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  53.27 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  48.33 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  45.9 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  47.11 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  46.77 
 
 		 126 aa  95.9  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  44.72 
 
 		 125 aa  93.6  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  47.27 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  52.78 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  43.9 
 
 		 125 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  41.8 
 
 		 125 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  44.92 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  44.86 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  46.94 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  55.88 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  47.54 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  40.32 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  41.67 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  42.59 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  40.71 
 
 		 121 aa  76.6  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  35.54 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  52.13 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  38.02 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  43.9 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  50.54 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  37.86 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  39.34 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  45.26 
 
 		 228 aa  72  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  41.59 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  38.84 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  36 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  43.8 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  37.84 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  41.38 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  32.79 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  41.38 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  38.61 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  32.79 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  36.89 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  40.35 
 
 		 193 aa  70.5  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  36.13 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1306  CrcB protein  39.81 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1468  CrcB protein  39.81 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  37.23 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  34.58 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  37.63 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  41.59 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  35.78 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  41.59 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  33.05 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  34.58 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  37.4 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  39.82 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  32.52 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  43.01 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  36.36 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1764  camphor resistance protein CrcB  48.78 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.342107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>