More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1306 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1468  CrcB protein  100 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1306  CrcB protein  100 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5115  Camphor resistance CrcB protein  93.1 
 
 		 127 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  52.38 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3566  crcB-like protein  54.95 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00153243  normal  0.458256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1143  CrcB protein  54.95 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  51.59 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1089  CrcB-like protein  54.29 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.678509  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  38.4 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  35.59 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  37.3 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0930  camphor resistance CrcB protein  39.34 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.942183  hitchhiker  0.00352151 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  31.15 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  30.33 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  30.33 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  31.15 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  31.15 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  31.15 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  37.07 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  34.21 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  31.15 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  29.51 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  30.33 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  30.58 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  30.16 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  36.75 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  39.39 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  36 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  32.54 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  40.23 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  38 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  31.93 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  31.75 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  25.41 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  32.54 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  35.24 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  35.94 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  27.2 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  40.35 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  31.97 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  30.7 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  31.09 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  33.94 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  31.09 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  33.86 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  34.86 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  31.36 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  32.77 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  33.06 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1283  camphor resistance protein CrcB  33.02 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  33.09 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  28.46 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  29.06 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  30.16 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  30.71 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  27.78 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1481  camphor resistance CrcB protein  31.31 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  38.14 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  35.85 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0818  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  30.65 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  28.1 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  30.71 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  29.37 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  35.25 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4411  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>