More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1662 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  244  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  48.33 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  48.33 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.61 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  40.83 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  41.32 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  43.81 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  38.52 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  38.33 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  53.41 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  35.77 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  37.72 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  38.21 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  38.21 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  44.09 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  38.66 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  39.84 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  34.75 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  41.6 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  35.4 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  35.59 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  37.5 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  34.13 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  37.74 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  39.45 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  37.4 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  44.21 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.52 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  39.83 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  38.71 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  41.11 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  38.95 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  36.07 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  30.89 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  32.5 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  40.22 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  33.05 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  40.83 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  36.22 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  33.06 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  40.71 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  37.7 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  36.75 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  35.9 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  37.89 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  37.3 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  38.68 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3282  Camphor resistance CrcB protein  39.05 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  35.34 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  35.59 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  38.68 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  38.89 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  42.53 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>