More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1439 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  100 
 
 		 123 aa  236  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  61.29 
 
 		 124 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  60.42 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2322  camphor resistance protein CrcB  62.26 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  50 
 
 		 124 aa  105  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2698  CrcB protein  71.28 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154728  hitchhiker  0.000362738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  48.08 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  44.92 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  51.89 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  57.14 
 
 		 114 aa  87  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  47.62 
 
 		 122 aa  85.9  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  41.6 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  42.86 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  43.8 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3029  camphor resistance protein CrcB  53.51 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  42.02 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3967  CrcB protein  47.17 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.336072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  35 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  41.03 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  34.17 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13087  camphor resistance protein CrcB  46.85 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3757  normal  0.719495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  42.16 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  48.45 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  43.86 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  37.86 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  35.25 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4411  camphor resistance protein CrcB  43.93 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  35.59 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  46.07 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  46.07 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  46.07 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0037  CrcB protein  33.33 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000769905  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  34.78 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  33.64 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  40.78 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  35.78 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  30.08 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  36.84 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  37.17 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  34.71 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  37.61 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  42.39 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5013  CrcB protein  43.75 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  32.52 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0930  camphor resistance CrcB protein  38.53 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.942183  hitchhiker  0.00352151 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1099  crcB protein  33.91 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.236283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  34.71 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  45.35 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  36.08 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  34.45 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  36.08 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>