278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5013 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_5013  CrcB protein  100 
 
 
116 aa  206  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  50.43 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  44.64 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  52.94 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  46.55 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  44.95 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
117 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  41.35 
 
 
120 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  44.14 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  39.45 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  39.45 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  39.45 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  32.48 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  42.86 
 
 
122 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01601  hypothetical protein  40.7 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  42.34 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  35.19 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  43.4 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2698  CrcB protein  51.09 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154728  hitchhiker  0.000362738 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  40.62 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  37.29 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  33.94 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  34.23 
 
 
132 aa  57.8  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  35.78 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  40.95 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  33.03 
 
 
118 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  42.11 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  33.03 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  44.58 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  33.03 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2322  camphor resistance protein CrcB  48.42 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  33.03 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  41.23 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  35.34 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  33.03 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  31.19 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  45.12 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  40.62 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  36.52 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  37.5 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  33.03 
 
 
118 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  34.88 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1480  CrcB protein  39.47 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  35.58 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  41.38 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  33.62 
 
 
122 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  32.43 
 
 
118 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01591  hypothetical protein  39.5 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  40.22 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  34.52 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0089  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  43.24 
 
 
123 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  34.55 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  34.55 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  35.23 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  29.66 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  36.29 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  30.91 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  36.56 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  32.46 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  39.78 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  29.91 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  41.67 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  40.78 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13087  camphor resistance protein CrcB  45.28 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3757  normal  0.719495 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  38.64 
 
 
122 aa  52  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  40.52 
 
 
129 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  40.62 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>