More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2563 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  100 
 
 
116 aa  223  6e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  49.57 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  43.48 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  43.2 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  43.48 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0372  CrcB protein  46.09 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  41.03 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  44.72 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  47.73 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  43.62 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0494  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.971623  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  43.48 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  38.66 
 
 
118 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  41.75 
 
 
116 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1099  crcB protein  36.75 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.236283  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  44.09 
 
 
117 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  41.59 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  42.55 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  37.17 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  36.52 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0338  Camphor resistance CrcB protein  50 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  37.19 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0930  camphor resistance CrcB protein  38.6 
 
 
119 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.942183  hitchhiker  0.00352151 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  39.13 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
118 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  38.84 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  40.23 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  37.72 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  35.4 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  37.39 
 
 
127 aa  60.8  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  35.09 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
118 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  35.14 
 
 
124 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  38.78 
 
 
123 aa  60.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  41.03 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  33.06 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  46.15 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  34.45 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  46.34 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  37.39 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  42.74 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  40.21 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  40.21 
 
 
127 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  38.14 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  33.62 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  34.94 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  40.21 
 
 
127 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  34.23 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  40.38 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  34.69 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  34.29 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0037  CrcB protein  32.8 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000769905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  45.88 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>