266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4411 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4411  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
122 aa  230  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  63.33 
 
 
122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13087  camphor resistance protein CrcB  68.7 
 
 
126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3757  normal  0.719495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  62.14 
 
 
119 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  62.14 
 
 
119 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  62.14 
 
 
119 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  47.47 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  43.93 
 
 
123 aa  81.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  45.95 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1948  camphor resistance protein CrcB  63.73 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  50.94 
 
 
118 aa  77  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  39.82 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5764  Camphor resistance CrcB protein  51 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  41.82 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  39.81 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 
120 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  34.91 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  36.52 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  43.14 
 
 
228 aa  67  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  37.27 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  33.96 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  45.92 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  35.78 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  33.96 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  33.02 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  34.91 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  33.96 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  33.96 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  33.96 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  37.8 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  33.96 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  33.96 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  31.3 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  37.07 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  34.58 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  33.91 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  41.24 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 
123 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  35.51 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  38.24 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  34.92 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  37.86 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  34.92 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  34.58 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  35.14 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  33.03 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  33.03 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  34.62 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  33.03 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  34.55 
 
 
162 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  33.03 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.83 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  37.5 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0930  camphor resistance CrcB protein  45.88 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.942183  hitchhiker  0.00352151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  33.94 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  37.74 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  41.03 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  33.91 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  37.01 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  31.78 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  40.62 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  32.17 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  35.19 
 
 
126 aa  57.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  30.09 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  33.62 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  30 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  35.79 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  40.2 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  40.38 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  35.58 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0455  Camphor resistance CrcB protein  42.86 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.592746  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  30 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>