More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1337 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 128 aa  247  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  75.41 
 
 		 124 aa  187  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  73.77 
 
 		 124 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  76.58 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  59.32 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  52.38 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  53.66 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  52.1 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  48.76 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  51.64 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  55.17 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  55.17 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  52.76 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  50.47 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  45.22 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  48.41 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  50.39 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  45.22 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  44.17 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  44.92 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  48.08 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  50.93 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  42.97 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  49.44 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  59.04 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  45.87 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  47.11 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  50.94 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  52.13 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  41.28 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  42.15 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  35.77 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  44.79 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  37.01 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  44.23 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  36.75 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  47.83 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  35.9 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  39.29 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  39.32 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  39.09 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  43.12 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  34.65 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  43.96 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  37.72 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  38.83 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1306  CrcB protein  39.62 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  32 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1468  CrcB protein  39.62 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  38.1 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  35.54 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5115  Camphor resistance CrcB protein  37.84 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  32 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  38.79 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  42 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  35.48 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  37.78 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  36.54 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  37.62 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  40.86 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3455  hypothetical protein  39.02 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0794685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  40.71 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  34.51 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  37.14 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  39.32 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  38.89 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  43.01 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  40.23 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  35.65 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  33.33 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  35.4 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  37.35 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  35.78 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>