More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1311 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  100 
 
 		 127 aa  239  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  58.54 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  56.91 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  58.93 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  54.4 
 
 		 124 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  50.39 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  54.84 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  56 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  54.1 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  54.92 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  52.8 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  47.97 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  51.85 
 
 		 107 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  51.06 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  47.71 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  45.31 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  43.55 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  46.81 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  46.4 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  46.4 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  39.37 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  46.79 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  38.1 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  47.32 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  36.8 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  42.62 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  48.25 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.67 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.67 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  41.13 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  37.8 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  39.09 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  40.34 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  38.21 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  40.57 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  39.82 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  46.74 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  36.22 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  39.32 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  36.72 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  46.74 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  45.56 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  31.45 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  40.77 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  44.09 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  38.33 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  39.83 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  42.34 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  45.67 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  37.9 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  35.14 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  41.3 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  37.93 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  43.33 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  34.92 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  34.17 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  40 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0149  crcB protein  41.82 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  34.96 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  41.38 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  34.23 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  37.39 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  43.01 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  43.3 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  40.17 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  39.32 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  40.17 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1339  CrcB family protein  38.84 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0192605  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  41.11 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0525  Camphor resistance CrcB protein  41.89 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  38.04 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  33.6 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  40 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0240  Camphor resistance CrcB protein  41.11 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0372  CrcB protein  42 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>