More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1029 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  100 
 
 		 124 aa  247  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  49.53 
 
 		 228 aa  104  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  40.52 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  40.5 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  43.64 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  42.98 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  40.37 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  43.59 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  46.3 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  41.96 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  41.96 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  31.4 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  41.07 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  38.14 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  38.84 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  41.12 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  31.45 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  40.74 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  41.07 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  37.39 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  34.68 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  35.16 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  36 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  46.15 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.06 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  35.54 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  39.32 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  33.9 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  36.79 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  34.43 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  37.11 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.06 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  39.13 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  34.96 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  39.32 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  36.28 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  38.74 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  41.46 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  36.7 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>