283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2423 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  100 
 
 		 127 aa  241  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  53.6 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  52.94 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  47.9 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  43.08 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3455  hypothetical protein  52.21 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0794685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  45.22 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  37.6 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  38.02 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  37.6 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  40.18 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  37.17 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1915  camphor resistance CrcB protein  53.45 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  39.32 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  38.68 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  38.68 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  41.75 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  43.52 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  37.76 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  36.44 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0455  Camphor resistance CrcB protein  47.78 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.592746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  45.83 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  39.25 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  39.36 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  37.82 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  39.36 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  40.17 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  42 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  39.81 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  42.42 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  37.74 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  40.2 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  34.45 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  41.88 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  42.22 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  42.22 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  34.02 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.27 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  37.14 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  34.02 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  32.79 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  34.88 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  36.22 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  37.25 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  39.05 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  36.75 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  37.14 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  37.29 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  38.26 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  40.74 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  40.43 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  35.83 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  42.15 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  33.96 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0818  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  38.24 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  40.2 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  36.59 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>