More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2021 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  241  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  88.71 
 
 		 124 aa  222  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  87.9 
 
 		 124 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  86.29 
 
 		 124 aa  214  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  86.29 
 
 		 124 aa  214  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  86.29 
 
 		 124 aa  214  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  86.29 
 
 		 124 aa  213  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  84.68 
 
 		 124 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  84.68 
 
 		 124 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  84.68 
 
 		 124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  84.68 
 
 		 124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  83.87 
 
 		 124 aa  209  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  79.03 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  76.61 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  69.35 
 
 		 124 aa  174  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  73.98 
 
 		 124 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  56.56 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  50.86 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  50.89 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  49.14 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  47.41 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  49.14 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  50.83 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  46.36 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.37 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  45.69 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  44.17 
 
 		 122 aa  93.6  9e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  41.6 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  51.72 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  40.83 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  41.53 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  40.91 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  39.84 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  41.07 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  39.47 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  42.55 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  44 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  43.86 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  42.27 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  45.65 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  42.61 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  43.56 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  37.93 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  39.5 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  40.95 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  40.95 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  43.7 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  45.28 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  41.53 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  41 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  45.63 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  38.33 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  40.98 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  39.66 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  39.32 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  41.49 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  35.83 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  40.95 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  41.49 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  41.88 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  41.67 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  38.84 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  37.84 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  35.83 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  38.79 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  40.45 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  41.94 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  40.34 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  39.32 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  40 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>