More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1973 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  421  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  51.69 
 
 		 124 aa  118  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  48.78 
 
 		 132 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  47.58 
 
 		 124 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  54.31 
 
 		 123 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  47.15 
 
 		 124 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  45.9 
 
 		 140 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  46.72 
 
 		 124 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  46.55 
 
 		 127 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  46.72 
 
 		 124 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  47.01 
 
 		 127 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  44.8 
 
 		 129 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 125 aa  99.4  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  45.3 
 
 		 127 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 		 133 aa  97.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 124 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  48.8 
 
 		 193 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 126 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 		 129 aa  96.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  47.01 
 
 		 131 aa  96.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 124 aa  96.7  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  48.76 
 
 		 124 aa  96.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  47.93 
 
 		 124 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 124 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 124 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 124 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  47.93 
 
 		 124 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  44.83 
 
 		 124 aa  95.9  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  46.85 
 
 		 126 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  47.93 
 
 		 124 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  47.93 
 
 		 124 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  42.86 
 
 		 142 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  43.55 
 
 		 128 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  45.3 
 
 		 143 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 134 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 134 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 124 aa  92  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 		 126 aa  91.7  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  45.97 
 
 		 132 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  47.86 
 
 		 127 aa  90.1  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  44.92 
 
 		 140 aa  90.1  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  47.41 
 
 		 125 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  47.41 
 
 		 125 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  48.25 
 
 		 124 aa  89.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  47.11 
 
 		 124 aa  88.6  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 		 124 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  37.3 
 
 		 122 aa  86.7  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  46.28 
 
 		 124 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  44.72 
 
 		 123 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  41.6 
 
 		 123 aa  85.9  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 126 aa  85.5  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 162 aa  85.1  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  46.28 
 
 		 124 aa  85.1  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  41.53 
 
 		 132 aa  84.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  44.17 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  46.77 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  36.29 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  42.37 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  39.52 
 
 		 122 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  40 
 
 		 151 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  46.02 
 
 		 122 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  45.3 
 
 		 124 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  45 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 		 128 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  46.24 
 
 		 99 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  42.5 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  44.26 
 
 		 131 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  39.17 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  48.74 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  37.5 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 		 126 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  41.74 
 
 		 128 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  41.84 
 
 		 122 aa  77.4  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  46.28 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  43.36 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  43.12 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  44.09 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  38.33 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  42.5 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  42.06 
 
 		 126 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  38.14 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  41.8 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  44.79 
 
 		 124 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  42.15 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>