298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2648 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  58.54 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  57.72 
 
 		 143 aa  143  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  47.69 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  48 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  47.15 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  40.16 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  41.74 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  42.06 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  41.8 
 
 		 270 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3455  hypothetical protein  47.11 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0794685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  37.93 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.07 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  35.94 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.76 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  44.66 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  37.98 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  37.98 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  33.59 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  34.96 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  39.09 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  32.81 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  32.81 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.67 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  37.27 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  34.62 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  36.13 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  39.52 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  40.86 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  34.15 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  34.15 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  34.02 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  31.97 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  33.6 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  41.03 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  38 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  29.46 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  33.61 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  39.76 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  38.14 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  36.51 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  40 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.73 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.73 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  39.13 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  26.67 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  38.6 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0818  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  31.45 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  34.68 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  34.35 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  34.38 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  35.65 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  29.31 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  33.06 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  37.36 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  37.36 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>