More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0981 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 123 aa  238  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  59.5 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  56.1 
 
 		 124 aa  147  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  56.78 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  56.78 
 
 		 125 aa  130  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  55.93 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  44.63 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  41.32 
 
 		 193 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  44.86 
 
 		 228 aa  87.8  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  43.75 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  40.68 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  39.02 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  46.74 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  48.21 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  45.65 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  45.65 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  38.53 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  38.53 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  40 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  45.54 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  42.02 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  47.19 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  40.98 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  37.5 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  31.71 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  42.15 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  47.67 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  35.54 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  47.67 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  47.67 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  39.83 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  42.5 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  41.9 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  37.86 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  37.7 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  39.67 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  45.36 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  41.3 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  38.05 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  41.3 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  44.44 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  36.8 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  37.7 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  43.3 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  44.12 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  36.61 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  41.67 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  43.33 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  40.59 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  40.4 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  43.12 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  43.3 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  40.59 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  44 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  44.09 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  44.21 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  38.02 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  41 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  44.33 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  46.15 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>