More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3583 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  239  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  85.48 
 
 		 124 aa  213  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  83.87 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  81.3 
 
 		 124 aa  200  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  81.3 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  81.3 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  74.19 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  59.81 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  40 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  45.22 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  37.61 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 		 129 aa  76.6  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  41.32 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3405  CrcB protein  63.89 
 
 		 66 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356254 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  43.7 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  36.75 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  36.21 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  30.17 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  41.74 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  33.33 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  39.47 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  48.19 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  43.14 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  37.29 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  41.59 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  32.76 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  32.76 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  37.84 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  37.84 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  33.93 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  40.43 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  31.71 
 
 		 193 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  39.56 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  33.33 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  45.88 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  31.58 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  42.05 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  43.9 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  45 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  42.86 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  34.68 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  35.2 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  40.66 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  35.83 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  41.07 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  34.68 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  37.61 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2393  Camphor resistance CrcB protein  43.69 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142578 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  27.52 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  43.18 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  32.74 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  41.28 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1284  integral membrane protein for chromosome condensation  38.95 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  38.21 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.62 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  38.1 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  38.24 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  40.82 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  36.67 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  39 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>