More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1606 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 125 aa  235  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  66.1 
 
 		 128 aa  155  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  65.55 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  63.56 
 
 		 128 aa  149  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  65.29 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  60.8 
 
 		 146 aa  144  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  57.28 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  57.28 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  56.8 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  53.33 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  51.61 
 
 		 129 aa  107  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  56.14 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  56.07 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  54.03 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  52.38 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  52.38 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  52.38 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  54.62 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  50.79 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  46.4 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  48.78 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  46.4 
 
 		 150 aa  97.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  50.43 
 
 		 126 aa  97.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  60 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  52.5 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  47.37 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  46.28 
 
 		 126 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  57.78 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  46.49 
 
 		 127 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  46.55 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  46.49 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  46.49 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  47.46 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  46.49 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  46.49 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  46.49 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  46.49 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  46.49 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  56.38 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  53.77 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  52.58 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  41.27 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  41.27 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  41.27 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  45.69 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  43.86 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  47.37 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  44.21 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  42.34 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  35.9 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  41.18 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  44.86 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01045  putative Protein CrcB-like protein  46.67 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0985412  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06121  putative Protein CrcB-like protein  46.67 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0202562  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  45.08 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  43.14 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  37.39 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  37.21 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0215  camphor resistance protein CrcB  45.3 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.181294  hitchhiker  0.00640614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  36.13 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  36.26 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  39.58 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  33.6 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>