More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4954 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
127 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  96.06 
 
 
127 aa  208  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  68.5 
 
 
127 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  62.81 
 
 
126 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  62.3 
 
 
126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  62.3 
 
 
150 aa  153  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  63.56 
 
 
129 aa  144  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  53.28 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  56.67 
 
 
128 aa  130  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  58.33 
 
 
147 aa  130  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  53.28 
 
 
127 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  53.28 
 
 
127 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  56.67 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  56.67 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  55.83 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  55.83 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  55.83 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  55.83 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  55.83 
 
 
128 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  55.83 
 
 
128 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  55.83 
 
 
128 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  55.83 
 
 
128 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  53.33 
 
 
137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  57.63 
 
 
129 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  56.56 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  51.18 
 
 
127 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  53.28 
 
 
126 aa  123  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  48.39 
 
 
127 aa  122  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  50 
 
 
127 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  56.41 
 
 
126 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  51.69 
 
 
127 aa  120  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  57.01 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  57 
 
 
127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  61.02 
 
 
132 aa  117  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  54.7 
 
 
126 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  55.79 
 
 
127 aa  115  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  50.85 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  50.85 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  50.85 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  50.85 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  50.85 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  50.85 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  50.85 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  50.85 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  50.85 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  62.93 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  55.34 
 
 
126 aa  114  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  54.76 
 
 
126 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  50.85 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  50.85 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  50.85 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  50.85 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  50.85 
 
 
127 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  52.42 
 
 
124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  49.15 
 
 
126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  58.49 
 
 
131 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  56.78 
 
 
125 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  58.49 
 
 
131 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  52.42 
 
 
146 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  51.69 
 
 
135 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  53.23 
 
 
154 aa  107  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  57.89 
 
 
126 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  57.26 
 
 
128 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01045  putative Protein CrcB-like protein  51.95 
 
 
87 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0985412  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06121  putative Protein CrcB-like protein  51.95 
 
 
87 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0202562  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0215  camphor resistance protein CrcB  52.07 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.181294  hitchhiker  0.00640614 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  47.83 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  44.71 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3474  camphor resistance protein CrcB  49.52 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  40.71 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0235  crcB protein  51.3 
 
 
123 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.616495  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  39.82 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  42.61 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  40.34 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  43.48 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  37.38 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  38.04 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  37.25 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  41.67 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>