More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0235 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0235  crcB protein  100 
 
 		 123 aa  233  9e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.616495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0215  camphor resistance protein CrcB  91.87 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.181294  hitchhiker  0.00640614 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  66.94 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  52.5 
 
 		 124 aa  97.8  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  53.72 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  51.67 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 		 127 aa  90.5  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  47.46 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  45.16 
 
 		 150 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  49.18 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  50.41 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  42.98 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  49.59 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  42.98 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  49.57 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  49.57 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  49.57 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  42.98 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  44.92 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  47.06 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  48.72 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  45.1 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  46.34 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  52.75 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  46.43 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  50.55 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  48.51 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  44.9 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  48.51 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  48.86 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  47.92 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  48.86 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  48.51 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  38.28 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  44.07 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  44.74 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  44.07 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  46.53 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  42.98 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  42 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  42.86 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  42.15 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  37.19 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  40 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  35.83 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  44.12 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  40.21 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  50.7 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  35 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.58 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  39.39 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  42.05 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  34 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  36.8 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  40.74 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  41.67 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  41.94 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  33.63 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0457  Camphor resistance CrcB protein  39.08 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.973479  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1338  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0111697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>