251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0776 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 127 aa  248  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  47.32 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  41.46 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  42.98 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 126 aa  84.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  41.46 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  46.39 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  41.53 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  43.86 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  42.34 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  46.24 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  42 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  41 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  41 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  42 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  38.54 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  38.79 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  33.87 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  37.11 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.57 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  32.99 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  38.64 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  35.85 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  31.03 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  33.33 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  42.31 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  36.36 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  32.76 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  41.03 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  36.96 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  36.46 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  39.74 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  39.74 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  39.74 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  39.74 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  39.74 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01591  hypothetical protein  32.46 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  32.76 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  33.65 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  34.09 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  34.09 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  38.54 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  34.09 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  32.46 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  30.19 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>