More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3030 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
127 aa  247  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
127 aa  247  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  99.21 
 
 
127 aa  246  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  68.6 
 
 
127 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  61.42 
 
 
127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  61.42 
 
 
127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  61.42 
 
 
127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  61.42 
 
 
127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  61.42 
 
 
127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  65 
 
 
127 aa  160  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 
127 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  63.93 
 
 
127 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 
127 aa  158  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 
127 aa  158  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 
127 aa  158  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 
127 aa  158  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 
127 aa  158  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 
127 aa  158  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  63.93 
 
 
127 aa  158  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  63.11 
 
 
127 aa  147  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  63.93 
 
 
127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  59.84 
 
 
127 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  58.27 
 
 
127 aa  127  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  55.26 
 
 
127 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  57.69 
 
 
127 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  57.69 
 
 
127 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  46.72 
 
 
126 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  45.9 
 
 
150 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  49.14 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  49.57 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  46.55 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  57.29 
 
 
131 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  57.29 
 
 
131 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 
128 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 
128 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 
128 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 
128 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  51.82 
 
 
128 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
128 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
128 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
128 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
128 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 
137 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
128 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
128 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
128 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
128 aa  100  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  46.43 
 
 
146 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
147 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 
126 aa  96.7  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  44.25 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  42.24 
 
 
129 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 
128 aa  93.6  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 
126 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  49.5 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 
126 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  48.96 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  41.27 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  45.83 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 
124 aa  84  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  44.34 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  41.28 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 
126 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  42.55 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  42.61 
 
 
122 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  44.21 
 
 
127 aa  77  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.36 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.36 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.21 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  42.34 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  42.16 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  38.02 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  45.65 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  45.65 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  40.54 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  38.68 
 
 
129 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>