More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0812 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  100 
 
 		 129 aa  249  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  61.67 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  61.67 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  61.67 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  61.67 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  62.81 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  60.83 
 
 		 128 aa  141  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  60.83 
 
 		 128 aa  141  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  60.83 
 
 		 128 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  59.32 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  59.17 
 
 		 128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  58.33 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  59.2 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  49.21 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  52.38 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  57.5 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  57.5 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  57.5 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  60.17 
 
 		 147 aa  133  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  50.79 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  66 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  62.39 
 
 		 132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  54.4 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  58.26 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  57.6 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  58.26 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  64 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  53.04 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  53.27 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  52.8 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  52.46 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  61.47 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  51.64 
 
 		 127 aa  120  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  55 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  50.88 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  50.88 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  50.88 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  50.88 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  50.88 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  54.55 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  50.88 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  50.88 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  50.88 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  50.88 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  47.41 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  56.3 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  52.89 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  46.55 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  46.55 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  53.85 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  53.21 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  53.21 
 
 		 131 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  51.61 
 
 		 125 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  53.39 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  54.17 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  51.26 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  51.26 
 
 		 128 aa  103  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  50.45 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  52.21 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0215  camphor resistance protein CrcB  53.33 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.181294  hitchhiker  0.00640614 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  47.22 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  45.37 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.44 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01045  putative Protein CrcB-like protein  46.99 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0985412  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06121  putative Protein CrcB-like protein  46.99 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0202562  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  43.93 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  41.28 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  43.24 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  36.84 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  35.4 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  41.75 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  34.75 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  37.63 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  41.74 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  39.62 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0235  crcB protein  51.67 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.616495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  38.6 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  36.89 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  42.86 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  39.81 
 
 		 124 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3474  camphor resistance protein CrcB  49.07 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  42.45 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>