More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3158 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  100 
 
 		 127 aa  245  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  96.85 
 
 		 127 aa  240  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  69.29 
 
 		 127 aa  161  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  67.72 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  64.75 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  63.2 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  62.99 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  62.99 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  62.99 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  62.99 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  62.99 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  62.99 
 
 		 127 aa  146  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  62.99 
 
 		 127 aa  146  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  62.99 
 
 		 127 aa  146  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  62.99 
 
 		 127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  63.93 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  60.63 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  54.62 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  52.46 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  48 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  49.18 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  49.18 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  53.77 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  53.77 
 
 		 127 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  51.02 
 
 		 126 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  47.75 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  47.41 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  46.9 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  47.86 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  46.85 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  46.79 
 
 		 128 aa  93.6  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  49.5 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  45.13 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  43.36 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  52.22 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  48.31 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  46.85 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  44.74 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  46.9 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  45.1 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  40.38 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  32.76 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  39.6 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  38.02 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.74 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  32.48 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  37.19 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  31.25 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  36.19 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  33.07 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  40.2 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  35.29 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  36.89 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>