More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1961 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 126 aa  245  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  78.4 
 
 		 126 aa  194  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  70.63 
 
 		 126 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  79.37 
 
 		 126 aa  180  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  68.25 
 
 		 126 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  57.26 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  57.63 
 
 		 128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  57.63 
 
 		 128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  57.63 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  57.63 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  57.63 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  57.63 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  57.63 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  57.63 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  57.63 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  56.78 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  56.78 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  57.63 
 
 		 147 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  52.1 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  55.93 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  55.08 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  50.41 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  53.33 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  55.05 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  48.25 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  48.74 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  54.9 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  54.55 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  55.14 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  52.94 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  53.1 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  53.1 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  50.91 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  46.49 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  49.09 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  49.11 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  51.33 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  43.22 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  50.43 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  51.79 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  42.37 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  45.87 
 
 		 127 aa  94.4  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  48.35 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  49.45 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  43.8 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  41.18 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  41.18 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  36.22 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0215  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.181294  hitchhiker  0.00640614 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  37.84 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 129 aa  67  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  48.84 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  37.62 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  39.58 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0235  crcB protein  44.63 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.616495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  38.24 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  36.44 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  39.78 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  39.78 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  36.54 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  31.03 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  39.42 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>