More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1269 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 126 aa  240  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  94.44 
 
 		 126 aa  231  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  87.9 
 
 		 126 aa  214  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  73.17 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  71.96 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  58.26 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  59.83 
 
 		 147 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  57.63 
 
 		 124 aa  126  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  58.97 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  59.83 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  58.26 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  59.83 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  58.12 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  58.12 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  58.12 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  58.12 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  58.97 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  58.97 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  58.97 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  58.97 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  58.97 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  57.26 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  54.92 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  52.5 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  50.42 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  54.39 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  57.01 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  51.67 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  53.33 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  54.81 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  56.44 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  52.68 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  52.88 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  50.42 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  53.91 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  47.75 
 
 		 127 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  46.85 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  46.85 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  48.74 
 
 		 128 aa  97.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  49.56 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  49.55 
 
 		 126 aa  94.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  53.47 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  50 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  53.47 
 
 		 131 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  51.09 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  42.98 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  42.98 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  47.11 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  43.36 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  41.18 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0215  camphor resistance protein CrcB  47.93 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.181294  hitchhiker  0.00640614 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  36.8 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  34.51 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  40.82 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  35.71 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  34.51 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  34.51 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  34.51 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  32.52 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  33.63 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  33.63 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0235  crcB protein  49.59 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.616495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  33.63 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  32.74 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  33.63 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  38.54 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  35.51 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  31.71 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>