More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2862 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 127 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  68.81 
 
 		 127 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  68.81 
 
 		 127 aa  153  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  54.4 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  62.81 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  53.6 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  53.6 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  54.33 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  57.94 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  57.02 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  64.42 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  56.14 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  56.67 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  55.26 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  55.26 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  53.6 
 
 		 125 aa  124  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  56.67 
 
 		 128 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  56.67 
 
 		 128 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  58.26 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  55.65 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  55.83 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  55 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  58.33 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  57.55 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  57.39 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  54.62 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  55 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  52.94 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  53.17 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  57.94 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  54.31 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  54.78 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  54.78 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  54.78 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  57.85 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  54.78 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  54.78 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  54.78 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  54.78 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  54.78 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  54.78 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  53.04 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  53.04 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  54.7 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  53.04 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  53.04 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  53.04 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  61.32 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  63.11 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  54.17 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  54.03 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  55.79 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  57.69 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  56.3 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  54.74 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  51.64 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  53.54 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  56.14 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3474  camphor resistance protein CrcB  55.24 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  48.67 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  44.72 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  44.72 
 
 		 122 aa  84.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  44.72 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  48.24 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0215  camphor resistance protein CrcB  55 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.181294  hitchhiker  0.00640614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  47.32 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06121  putative Protein CrcB-like protein  50 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0202562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01045  putative Protein CrcB-like protein  50 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0985412  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  43.36 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  40.32 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  40.22 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  40.8 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  38.33 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  40 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  38.89 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  44.21 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  44.23 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0235  crcB protein  53.72 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.616495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  38.33 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  39.81 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  41.28 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  39.58 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>